私の研究室では、ゲノムDNAの塩基配列を解析して系統樹を作ることで、生物や分子の進化に関する情報を得る研究を行っています。新たな塩基配列データを 得たときに、それが既知の塩基配列とどのような関係にあるか（例えばゲノム上での遺伝子重複に依るのか）を迅速に知る必要があります。 BlastStation 2を使えば、そのような解析を簡単に行え、解析結果を非常に分かりやすい画面で確認することができます。もう一つ特筆すべきは、 BlastStation2の製作者が、私の質問や要望に大変丁寧に応対して下さったことです。これからもユーザーフレンドリーなツールとして私たちの研 究を支え続けて頂きたいと願っています。
I use BlastStation to conveniently search large RNA-seq transcriptomic data files obtained from tissues of non-model species. The software has made it a breeze to match unknown sequences to a known sequence from another species. The GUI is very user friendly and I have not experienced any problems with the software crashing. The use of BlastStation has saved me hours of time.
I've used Blaststation mainly to probe RNA-Seq data, but also used it to search genome sequence data. I find it very convenient to be able to quickly create a database from a large transcriptome fasta file or a genome sequence file, which can then be used to blast against with either a single sequence or a fasta file of multiple sequences. The graphic output is also visually helpful.
1. BlastStationで何ができますか？
DNAまたはタンパク質の配列からBLASTアルゴリズムを用いた相同性検索を行い、似た配列を持つDNAあるいはタンパク質をデータベースから見つけ出します。BlastStation2ではEBIのサーバーを用いたNCBI BLAST+、ローカルパソコンを用いたNCBI BLASTの各検索が可能です。
いずれの検索の場合も同じインターフェースで簡単にBLAST検索を実行できます。
2. 何種類かBlastStationがあるようですが、その違いは何ですか？
BlastStation2はEBIのNCBI BLAST、ローカルNCBI BLAST検索すべての検索機能を持ったBlastStationです。
BlastStation-Local64は64-bitのNCBI BLAST+(Mac OS X版)またはNCBI BLAST(Windows版)ローカル検索専用のBlastStationです。
3. 何個くらいのクエリー配列を一度に検索できますか？
製品版ではクエリー配列数に制限はございません。
トライアル版ではBlastStation-Local64では100個まで、BlastStation2では150個までに制限させていただいています。
4. ライセンスを購入し支払いも済ませたユーザですが、BlastStationを起動しようとすると「お客様にはライセンス使用料をお支払いいただいていません。お支払いいただくまでBlastStationは起動できません。」と表示されて起動できません。
BlastStationライセンスは1CPUライセンスで、２台以上のパソコンでは使用できません。購入されたライセンスを２台以上のパソコンで起動しようとするとこのメッセージが表示されます。新しいパソコンにライセンスを移行したいときはライセンス移行リクエストをお送りください。ただしライセンス移行は半年に１回までとさせていただきます。
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